More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1979 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 404 aa  833    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  59.75 
 
 		 408 aa  478  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  56.54 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  50 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  49.3 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  47.88 
 
 		 429 aa  398  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  45.54 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  46.71 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.62 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.07 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  33.73 
 
 		 442 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  34.37 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.76 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  34.69 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.34 
 
 		 427 aa  229  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  36.19 
 
 		 429 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  34.51 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  32.94 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  32.02 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  32.64 
 
 		 810 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  32.49 
 
 		 813 aa  220  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  34.44 
 
 		 424 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  32.87 
 
 		 847 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.85 
 
 		 429 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  33.89 
 
 		 413 aa  215  9e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 		 424 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  32.39 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  31.67 
 
 		 840 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  42.41 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.6 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 		 432 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 		 441 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  32.34 
 
 		 817 aa  209  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  31.31 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  34.26 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.65 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  31.66 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  30.37 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  29.01 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  34.17 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  33.85 
 
 		 463 aa  202  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  33.11 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.79 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  30.02 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  31.69 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  31.94 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  32.65 
 
 		 474 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  33.87 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.04 
 
 		 457 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  32.05 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  32.02 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  30.56 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  32.98 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  33.83 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  36.23 
 
 		 438 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.51 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  28.64 
 
 		 878 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1277  FolC bifunctional protein  32.91 
 
 		 419 aa  186  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.12741  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.51 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  31.72 
 
 		 431 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  30.63 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  33.06 
 
 		 427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  31.83 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  31.27 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  33.33 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  32.82 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  30.81 
 
 		 450 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  30.34 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  29.04 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.71 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  33.17 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  29.6 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  31.12 
 
 		 447 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  34.53 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.34 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  32.95 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  36.92 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  32.87 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  33.88 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  30.11 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  30.11 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  30.11 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.98 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.36 
 
 		 466 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  30.11 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  31 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  30.48 
 
 		 438 aa  176  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  31.48 
 
 		 423 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>