More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1953 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  100 
 
 
357 aa  734    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  75.14 
 
 
358 aa  575  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  75.99 
 
 
358 aa  576  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 
357 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 
361 aa  444  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 
357 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  58.19 
 
 
359 aa  435  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 
354 aa  428  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  58.54 
 
 
357 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 
355 aa  426  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
356 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 
363 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 
359 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
360 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 
358 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  49.58 
 
 
357 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  49 
 
 
356 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 
357 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  47.03 
 
 
357 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 
357 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
362 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
360 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 
361 aa  363  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 
362 aa  362  4e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  51.38 
 
 
360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 
360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 
360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 
363 aa  360  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 
359 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 
358 aa  358  6e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  48.45 
 
 
355 aa  358  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
356 aa  358  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 
361 aa  358  7e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 
360 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 
360 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 
358 aa  357  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  53.53 
 
 
358 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
361 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
358 aa  355  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
358 aa  355  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 
356 aa  355  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
362 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
362 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
355 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  47.44 
 
 
360 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  48.56 
 
 
364 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
361 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  48.42 
 
 
361 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 
360 aa  353  2e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 
357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  48.58 
 
 
360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  50 
 
 
355 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 
361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 
363 aa  352  8e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
360 aa  352  8e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  46.99 
 
 
362 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  46.99 
 
 
362 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0723  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
361 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.905014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 
355 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 
355 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 
363 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 
363 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  47.44 
 
 
360 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 
363 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 
358 aa  349  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 
363 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 
355 aa  349  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  48.24 
 
 
362 aa  348  7e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 
358 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 
358 aa  348  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 
358 aa  348  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 
358 aa  348  8e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 
358 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  48.02 
 
 
361 aa  348  8e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  48.58 
 
 
356 aa  348  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
357 aa  348  9e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
352 aa  347  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  47.65 
 
 
362 aa  348  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  47.44 
 
 
360 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 
357 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 
355 aa  346  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 
355 aa  346  4e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 
363 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 
363 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 
363 aa  346  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 
363 aa  345  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  46.44 
 
 
355 aa  345  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  46.15 
 
 
358 aa  345  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 
363 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 
363 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  48.69 
 
 
361 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  51.72 
 
 
360 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 
360 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 
361 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5476  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 
360 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 
361 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>