47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1929 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  776    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  36.8 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  38.52 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  38.27 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  35.81 
 
 		 396 aa  222  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  34.46 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  34.49 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  30.33 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  32.81 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  33.52 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  30.18 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  31.36 
 
 		 401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  31.82 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  32.05 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  30 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  27.86 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  29.8 
 
 		 417 aa  140  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  26.98 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  23.69 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  24.43 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  23.62 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  23.86 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  22.66 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  23.93 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  21.5 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  20.98 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  20.98 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  20.98 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  28.67 
 
 		 554 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  26.6 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  21.57 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1395  putative methyltransferase  28.89 
 
 		 175 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1441  methyltransferase  28.89 
 
 		 175 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  22.84 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  24.67 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  25.17 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  25.17 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.43 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.99 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.55 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.99 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  27.22 
 
 		 184 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.21 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.67 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  21.21 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  35.8 
 
 		 198 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>