60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1918 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  100 
 
 		 148 aa  309  7.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  52.74 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  42.47 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  35.17 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  33.1 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  32.87 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  30.82 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  31.47 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  32.17 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  31.47 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  31.47 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  31.47 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  30.14 
 
 		 158 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  30.07 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  32.06 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  35.67 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  31.58 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  30.72 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  31.76 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  32.45 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  33.33 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  29.05 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  29.22 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  32.67 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  31.54 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  28.38 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  32.19 
 
 		 149 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  28.38 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  28.95 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  29.37 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 300 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  27.27 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  23.49 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  28.29 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  29.33 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  27.27 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  29.93 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  26.53 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  24.36 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  29.93 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  31.03 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  26.67 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  26.9 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  28.48 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  23.89 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  25 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  28.48 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  25.88 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  27.54 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 277 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  25 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>