More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1723 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  69.6 
 
 		 126 aa  169  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  58.27 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  59.52 
 
 		 126 aa  153  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  58.27 
 
 		 227 aa  149  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  61.79 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  58.59 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  59.06 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  62.1 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  57.36 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  56.1 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 125 aa  140  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  56.8 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  55.91 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  51.61 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  52.42 
 
 		 125 aa  135  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 125 aa  135  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  51.61 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  56.1 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  54.03 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 124 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  52.42 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  51.61 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  49.21 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  48 
 
 		 130 aa  127  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  54.92 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  51.2 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  49.21 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  47.62 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  51.59 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  51.59 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  50.41 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  48.82 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>