More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1700 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  55.52 
 
 
650 aa  749    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
660 aa  1362    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  44.75 
 
 
653 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  42.86 
 
 
665 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  43.2 
 
 
643 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 
666 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 
642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  36.87 
 
 
645 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  35.46 
 
 
626 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  33.75 
 
 
630 aa  317  6e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 
677 aa  303  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
712 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.7 
 
 
668 aa  283  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  31.14 
 
 
648 aa  277  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  26.75 
 
 
757 aa  259  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  30.34 
 
 
656 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  30.25 
 
 
672 aa  212  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.49 
 
 
673 aa  191  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.31 
 
 
903 aa  190  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  40.42 
 
 
798 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  31.83 
 
 
640 aa  184  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
813 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  26.85 
 
 
671 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 
340 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  30.56 
 
 
630 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  29.64 
 
 
734 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  24.12 
 
 
613 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  32.58 
 
 
641 aa  167  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 
585 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  27.59 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  25.99 
 
 
631 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  26.3 
 
 
679 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  29.73 
 
 
620 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 
638 aa  151  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 
778 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  26.85 
 
 
658 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.52 
 
 
656 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.98 
 
 
510 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  26.65 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  28.27 
 
 
694 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  29.82 
 
 
710 aa  134  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  26.05 
 
 
509 aa  134  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  26.62 
 
 
704 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  28.66 
 
 
669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  27.7 
 
 
631 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.39 
 
 
525 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.32 
 
 
712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  26.42 
 
 
670 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  25.97 
 
 
673 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  23.49 
 
 
648 aa  117  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  28.54 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.68 
 
 
519 aa  100  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  27.29 
 
 
594 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  43.24 
 
 
366 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  26.84 
 
 
586 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  48.1 
 
 
568 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 
412 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.71 
 
 
230 aa  89  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 
637 aa  88.6  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 
1755 aa  87.8  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.28 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  39.09 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  29.61 
 
 
623 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.9 
 
 
211 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.35 
 
 
447 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.54 
 
 
321 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  34.17 
 
 
241 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  27.51 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.53 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.66 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.59 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.61 
 
 
240 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  33.04 
 
 
365 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
459 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  37.36 
 
 
266 aa  79.7  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  40 
 
 
457 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 
468 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.93 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 
204 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  38.33 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  37.29 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  34.11 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  36.61 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.68 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  34.17 
 
 
199 aa  77  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  30.17 
 
 
263 aa  77  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.61 
 
 
330 aa  77  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  34.68 
 
 
239 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.29 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 
296 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  33.9 
 
 
184 aa  75.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 
228 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>