More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1699 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  55.52 
 
 
660 aa  749    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
650 aa  1330    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  47.58 
 
 
653 aa  596  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  46.8 
 
 
643 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  45.47 
 
 
665 aa  564  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  42.69 
 
 
666 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  40.92 
 
 
642 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 
645 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  36.59 
 
 
626 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  34.45 
 
 
757 aa  353  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  34.69 
 
 
630 aa  342  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  39.85 
 
 
712 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  33.55 
 
 
668 aa  293  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  31.84 
 
 
648 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  32.56 
 
 
677 aa  290  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 
613 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  33.08 
 
 
656 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.66 
 
 
798 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.12 
 
 
672 aa  222  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  30.11 
 
 
903 aa  211  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.65 
 
 
673 aa  200  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  26.99 
 
 
640 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 
813 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  27.35 
 
 
671 aa  190  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  29.46 
 
 
631 aa  190  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  41.01 
 
 
340 aa  188  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 
630 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  28.6 
 
 
734 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  26.26 
 
 
658 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  27.09 
 
 
620 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  28.69 
 
 
471 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  27.53 
 
 
585 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  27.15 
 
 
641 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 
638 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  30.04 
 
 
679 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  29.62 
 
 
778 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  27.06 
 
 
712 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.5 
 
 
656 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  25.95 
 
 
648 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  26.93 
 
 
704 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  29.87 
 
 
710 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  24.77 
 
 
537 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  26.06 
 
 
631 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  27.14 
 
 
694 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  29.08 
 
 
669 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  24.54 
 
 
670 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  28.12 
 
 
510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  26.98 
 
 
594 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  24.11 
 
 
673 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  24.18 
 
 
517 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  24.76 
 
 
525 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  29.8 
 
 
519 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  28.19 
 
 
586 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  26.45 
 
 
509 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  40.91 
 
 
366 aa  95.5  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
362 aa  94  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
568 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.06 
 
 
447 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.13 
 
 
365 aa  90.9  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.74 
 
 
230 aa  90.5  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
1755 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  34.44 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  36.72 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 
454 aa  84  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  40 
 
 
457 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  29.08 
 
 
227 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 
637 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  39.45 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  37.72 
 
 
375 aa  82.8  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 
459 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 
223 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.78 
 
 
422 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.79 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  34.75 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.18 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  36.15 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  32.48 
 
 
241 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.68 
 
 
321 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  26.98 
 
 
263 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 
537 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  24.82 
 
 
504 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  33.33 
 
 
424 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.05 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 
623 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  30.28 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  28.51 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  34.85 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.85 
 
 
344 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.85 
 
 
344 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.85 
 
 
344 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 
468 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 
459 aa  76.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 
236 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  26.62 
 
 
240 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.82 
 
 
533 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.33 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>