More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1691 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  178  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  71.59 
 
 		 92 aa  127  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1445  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 88 aa  126  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  64.84 
 
 		 91 aa  117  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  63.74 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  50.56 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  57.32 
 
 		 87 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  57.32 
 
 		 87 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  52.38 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  51.14 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0330  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 		 95 aa  90.1  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  53.09 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  46.07 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>