More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1667 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 92 aa  186  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  88.64 
 
 		 98 aa  164  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09983  ribosomal protein S18  80.23 
 
 		 100 aa  147  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.596989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  72.09 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  81.43 
 
 		 83 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  65.22 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  69.32 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  78.08 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  75.34 
 
 		 83 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  72.86 
 
 		 83 aa  114  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  60.87 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 80 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 80 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 77 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  61.54 
 
 		 74 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 65 aa  90.1  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 74 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2393  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  60.66 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3035  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2828  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0913  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.317596 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  66.07 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0983  30S ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  56.25 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2823  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.408333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1309  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2445  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1184  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0394823  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2195  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00559271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1245  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0202382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5227  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1402  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.494221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3214  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0430  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.69422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2567  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0422  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000044811  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  59.02 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5729  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5172  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1230  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.024514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  47.67 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1820  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2004  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1977  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.402888  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2454  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427357  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 76 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1090  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1215  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.30025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0651  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1528  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0286405  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1133  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>