109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1643 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 259 aa  536  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  50.57 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  48.3 
 
 		 271 aa  241  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  46.42 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  30.81 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  30.73 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  27.27 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  27.56 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.8 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  25.51 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  26.36 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.1 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.74 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  25.57 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0509  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.13 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.591495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.85 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.53 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  24.39 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.29 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  24.72 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  22.36 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  29.73 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  24.88 
 
 		 221 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.99 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  22.27 
 
 		 246 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.26 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.47 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.99 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  25.2 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.01 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  23.9 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 345 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  26.9 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>