165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1616 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  59.26 
 
 		 270 aa  317  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  60.46 
 
 		 271 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  57.93 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  58.89 
 
 		 270 aa  305  7e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  57.14 
 
 		 269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  56.83 
 
 		 271 aa  301  8.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  56.02 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  54.65 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  56.77 
 
 		 269 aa  294  8e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  57.09 
 
 		 270 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  57.72 
 
 		 272 aa  291  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  56.57 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  55.13 
 
 		 271 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  54.41 
 
 		 271 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  58.46 
 
 		 270 aa  275  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  54.92 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  55.43 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  51.82 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  52.06 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  51.53 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  48.35 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  49.8 
 
 		 264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  48.46 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  42.48 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  41.26 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  41.26 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  44.31 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  37.8 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  40.89 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  39.64 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  41.6 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  40.08 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  44.75 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  44.75 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  38.17 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  37.82 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  39.16 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  39.75 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  41.36 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  36.53 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  40.56 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  38.97 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  37.4 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  36.73 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  39.45 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  36.67 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  37.64 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  38.74 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  39.08 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  38.26 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  35.27 
 
 		 297 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  38.06 
 
 		 306 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  35.27 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  37.89 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  38.34 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  37.94 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  36.03 
 
 		 312 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  38.78 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  36.8 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  36.4 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  36.22 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  37.08 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  40.64 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  35.08 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  35.34 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  32.39 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  37.83 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  31.72 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  34.57 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  35.08 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  34.87 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  39.92 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  37.21 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  30.98 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  31.64 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  28.94 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  28.51 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  30.04 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  31.01 
 
 		 267 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  30.95 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  32.48 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  31.47 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  29.89 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  26.84 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  30.3 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  28 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  29.24 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  29.26 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  29.59 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  31.65 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  35.56 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  29.05 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  28.81 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  26.81 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  29.15 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  27.46 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  29.49 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  27.46 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  29.12 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>