More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1555 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 415 aa  827    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  55.77 
 
 		 415 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  55.05 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  43 
 
 		 413 aa  326  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  45 
 
 		 413 aa  319  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  42.48 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3371  protein of unknown function DUF214  37.08 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270036  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  31.26 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  31.39 
 
 		 417 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  31.81 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.57 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.33 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  30.24 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 		 421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  30.49 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.92 
 
 		 411 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  29.95 
 
 		 415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.4 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  28.44 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.94 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  31.14 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  30.14 
 
 		 409 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.67 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.12 
 
 		 443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30.37 
 
 		 402 aa  166  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  30.79 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.67 
 
 		 642 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  30.75 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  28.84 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  28.81 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.68 
 
 		 410 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  30.32 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.93 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.14 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.75 
 
 		 405 aa  161  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  29.45 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  26.65 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  29.16 
 
 		 414 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.55 
 
 		 399 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.67 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.49 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  30.44 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  30.98 
 
 		 417 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.84 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  30.44 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  29.27 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  31.1 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  27.42 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  30.38 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.16 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  29.01 
 
 		 410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  27.88 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  30.05 
 
 		 644 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.05 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  29.47 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  28.77 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  26.76 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.88 
 
 		 642 aa  153  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.31 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  27.66 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.37 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  27.96 
 
 		 414 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  26.03 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.67 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  29.4 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.67 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.34 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  29.06 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  29.41 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  28.36 
 
 		 656 aa  150  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  26.6 
 
 		 668 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  29.52 
 
 		 404 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  26.76 
 
 		 409 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 		 392 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  29.83 
 
 		 409 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>