More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1522 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1522  PAS sensor protein  100 
 
 		 225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.533099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1521  putative PAS/PAC sensor protein  67.26 
 
 		 228 aa  328  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.950455  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1964  putative PAS/PAC sensor protein  47.53 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2525  putative PAS/PAC sensor protein  42.99 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0659487  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1378  putative PAS/PAC sensor protein  45.69 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2936  putative PAS/PAC sensor protein  48.28 
 
 		 201 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178135  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1223  signal-transduction sensor protein  43.37 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.658782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3403  PAS sensor protein  39.77 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4975  putative PAS/PAC sensor protein  33.53 
 
 		 178 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4977  putative PAS/PAC sensor protein  37.42 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4009  PAS  38.82 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0158  PAS sensor protein  38.65 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00559927  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1071  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 178 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0920  putative PAS/PAC sensor protein  41.1 
 
 		 170 aa  125  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.99 
 
 		 182 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4662  putative PAS/PAC sensor protein  38.27 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2378  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4683  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 		 173 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1413  putative PAS/PAC sensor protein  39.29 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.026067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05500  PAS domain S-box  36.99 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1012  methyl-accepting chemotaxis protein  38.16 
 
 		 171 aa  118  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63093  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0368  PAS sensor protein  38.61 
 
 		 168 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0044  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1962  methyl-accepting chemotaxis protein  38.78 
 
 		 166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3464  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 		 532 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1233  methyl-accepting chemotaxis protein  33.96 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1312  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  0.171791 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2224  putative PAS/PAC sensor protein  48.51 
 
 		 142 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 		 520 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 174 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4792  putative PAS/PAC sensor protein  33.14 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.75 
 
 		 516 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.1353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  54.65 
 
 		 522 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1323  methyl-accepting chemotaxis protein  32.72 
 
 		 165 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2812  putative PAS/PAC sensor protein  40.77 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494423  decreased coverage  0.000000324615 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1204  methyl-accepting chemotaxis protein  32.72 
 
 		 165 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.49 
 
 		 522 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50 
 
 		 521 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.49 
 
 		 522 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 		 522 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1648  aerotaxis receptor  55.26 
 
 		 521 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 		 522 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50.57 
 
 		 522 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.160306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0532  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.67 
 
 		 523 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0374128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  49.47 
 
 		 543 aa  101  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.86 
 
 		 1170 aa  101  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 		 533 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  48.89 
 
 		 521 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.89 
 
 		 521 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.35 
 
 		 524 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.78 
 
 		 521 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1385  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 520 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3735  PAS  53.95 
 
 		 521 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2292  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40 
 
 		 517 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1833  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  50 
 
 		 521 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.884809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 		 532 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 		 522 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  51.09 
 
 		 511 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 532 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.415489  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.67 
 
 		 521 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.378373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.07 
 
 		 716 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 		 521 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.95 
 
 		 521 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664053  normal  0.0821551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2233  putative PAS/PAC sensor protein  42.45 
 
 		 177 aa  99.8  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.63 
 
 		 534 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.84 
 
 		 521 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.258308  normal  0.504821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4521  aerotaxis receptor, putative  52.63 
 
 		 521 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0540  methyl-accepting chemotaxis protein  33.13 
 
 		 166 aa  99.4  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  56.58 
 
 		 552 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0302709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 522 aa  99  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.72 
 
 		 901 aa  98.6  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  47.96 
 
 		 598 aa  98.6  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1652  putative PAS/PAC sensor protein  42.99 
 
 		 127 aa  98.6  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.129926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  55.26 
 
 		 551 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.98 
 
 		 515 aa  98.2  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2257  aerotaxis receptor Aer-1  45.56 
 
 		 521 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215452  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0964  putative PAS domain signal transduction sensor protein  37.01 
 
 		 163 aa  98.2  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.695373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3404  methyl-accepting chemotaxis protein  41.22 
 
 		 522 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0333  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.28 
 
 		 720 aa  98.2  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 		 538 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0659  putative PAS/PAC sensor protein  40.65 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02941  fused signal transducer for aerotaxis sensory component/methyl accepting chemotaxis component  39.58 
 
 		 506 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.58 
 
 		 506 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  39.85 
 
 		 518 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185607  normal  0.0170041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1621  methyl-accepting chemotaxis protein  49.43 
 
 		 513 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02891  hypothetical protein  39.58 
 
 		 506 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  41.38 
 
 		 1214 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  42.06 
 
 		 945 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0995  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 		 517 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3253  aerotaxis receptor  39.58 
 
 		 506 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3403  aerotaxis receptor  38.61 
 
 		 506 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3573  aerotaxis receptor  38.61 
 
 		 506 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0352648  normal  0.227962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0262  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 		 524 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4927  methyl-accepting chemotaxis protein/sensory box protein  50 
 
 		 511 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3477  aerotaxis receptor  38.61 
 
 		 506 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0963  putative PAS domain signal transduction sensor protein  31.79 
 
 		 163 aa  96.7  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.598174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  52.63 
 
 		 521 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.629648  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3511  aerotaxis receptor  38.61 
 
 		 506 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000402751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.31 
 
 		 522 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.737349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>