More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1483 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  41.01 
 
 		 992 aa  739    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  48.89 
 
 		 997 aa  935    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.33 
 
 		 953 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.9 
 
 		 1002 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  54.07 
 
 		 971 aa  1080    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  42.46 
 
 		 990 aa  745    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.21 
 
 		 1018 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  38.59 
 
 		 1007 aa  662    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 976 aa  2013    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  39.33 
 
 		 1012 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  34.6 
 
 		 1003 aa  588  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  33.02 
 
 		 966 aa  500  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.68 
 
 		 568 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  34.31 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  35.52 
 
 		 603 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  32.25 
 
 		 585 aa  282  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.91 
 
 		 589 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  35.38 
 
 		 537 aa  280  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.04 
 
 		 698 aa  278  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.57 
 
 		 583 aa  275  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.36 
 
 		 582 aa  274  7e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.79 
 
 		 596 aa  262  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.93 
 
 		 543 aa  262  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.71 
 
 		 591 aa  260  9e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  31.63 
 
 		 604 aa  254  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.11 
 
 		 573 aa  252  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  30.97 
 
 		 592 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.94 
 
 		 600 aa  240  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.75 
 
 		 528 aa  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.33 
 
 		 618 aa  232  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  31.35 
 
 		 520 aa  232  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.06 
 
 		 580 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  34.07 
 
 		 656 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.01 
 
 		 537 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.68 
 
 		 558 aa  227  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  37.64 
 
 		 444 aa  225  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.86 
 
 		 534 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.86 
 
 		 534 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  31.66 
 
 		 552 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  37.13 
 
 		 542 aa  219  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  28.86 
 
 		 631 aa  217  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.61 
 
 		 426 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.87 
 
 		 511 aa  216  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.92 
 
 		 427 aa  215  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 		 845 aa  214  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  35.35 
 
 		 538 aa  214  9e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.2 
 
 		 420 aa  211  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.26 
 
 		 552 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  27.59 
 
 		 586 aa  207  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.31 
 
 		 543 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.16 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  32.48 
 
 		 434 aa  201  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.15 
 
 		 517 aa  201  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  37.22 
 
 		 549 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.88 
 
 		 365 aa  199  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.88 
 
 		 365 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  34.56 
 
 		 365 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.76 
 
 		 503 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.4 
 
 		 511 aa  194  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 633 aa  194  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.74 
 
 		 543 aa  194  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  34.26 
 
 		 365 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  39.93 
 
 		 673 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  34.44 
 
 		 538 aa  190  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  28.33 
 
 		 541 aa  189  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  38.55 
 
 		 498 aa  189  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.73 
 
 		 594 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  28.08 
 
 		 699 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  42.13 
 
 		 499 aa  184  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.26 
 
 		 598 aa  184  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  28.89 
 
 		 699 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  28.89 
 
 		 699 aa  183  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.99 
 
 		 793 aa  181  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.11 
 
 		 387 aa  181  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  28.69 
 
 		 699 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  30.67 
 
 		 385 aa  178  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.33 
 
 		 490 aa  177  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.27 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.42 
 
 		 490 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.76 
 
 		 484 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.21 
 
 		 482 aa  173  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  28.93 
 
 		 759 aa  172  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  28.21 
 
 		 688 aa  171  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  27.21 
 
 		 779 aa  171  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  27.97 
 
 		 557 aa  171  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  26.51 
 
 		 596 aa  168  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  37.76 
 
 		 531 aa  168  5e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  28.11 
 
 		 575 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  29.56 
 
 		 395 aa  167  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  34.6 
 
 		 637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.43 
 
 		 504 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.57 
 
 		 379 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 		 562 aa  165  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  29.04 
 
 		 379 aa  164  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.14 
 
 		 382 aa  163  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 		 386 aa  163  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  32.95 
 
 		 468 aa  163  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 		 398 aa  162  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  33.93 
 
 		 370 aa  161  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>