More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1453 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53.03 
 
 		 633 aa  652    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  55.3 
 
 		 640 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.38 
 
 		 640 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  53.61 
 
 		 636 aa  641    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  52.69 
 
 		 640 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 658 aa  1365    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  70.03 
 
 		 654 aa  926    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  53.38 
 
 		 638 aa  677    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  53.6 
 
 		 642 aa  656    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  53.08 
 
 		 643 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  53.56 
 
 		 645 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  52.62 
 
 		 640 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  54.17 
 
 		 642 aa  665    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  52.11 
 
 		 650 aa  651    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  54.95 
 
 		 650 aa  714    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  57.7 
 
 		 633 aa  691    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  52.62 
 
 		 640 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  61.47 
 
 		 649 aa  808    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  52.62 
 
 		 640 aa  643    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  70.17 
 
 		 652 aa  916    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  54.71 
 
 		 635 aa  655    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  52.77 
 
 		 640 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  52.05 
 
 		 654 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  50.3 
 
 		 656 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  53.1 
 
 		 648 aa  660    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  67.18 
 
 		 651 aa  899    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  53.32 
 
 		 645 aa  660    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  53.74 
 
 		 636 aa  684    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  55.62 
 
 		 633 aa  682    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54 
 
 		 640 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  55.37 
 
 		 640 aa  697    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  51 
 
 		 655 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  54.49 
 
 		 644 aa  668    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  53.04 
 
 		 637 aa  665    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  57.47 
 
 		 644 aa  768    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  59.79 
 
 		 644 aa  768    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  53.58 
 
 		 644 aa  639    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  59.08 
 
 		 637 aa  759    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  51.54 
 
 		 655 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  50.62 
 
 		 636 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  54.63 
 
 		 640 aa  706    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  57.6 
 
 		 638 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  52.62 
 
 		 640 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  63.26 
 
 		 666 aa  823    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  51 
 
 		 637 aa  638    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  51 
 
 		 655 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  54.31 
 
 		 648 aa  673    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  54.06 
 
 		 634 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  51.04 
 
 		 665 aa  672    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  49.85 
 
 		 675 aa  649    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  77.21 
 
 		 646 aa  1049    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  56.45 
 
 		 632 aa  697    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  54.26 
 
 		 641 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54 
 
 		 640 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  58.99 
 
 		 644 aa  779    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  51.62 
 
 		 653 aa  636    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  52.12 
 
 		 644 aa  670    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  51.21 
 
 		 651 aa  636    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  67.48 
 
 		 652 aa  905    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.63 
 
 		 638 aa  665    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.78 
 
 		 638 aa  666    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  53.38 
 
 		 647 aa  643    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.85 
 
 		 636 aa  651    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.42 
 
 		 633 aa  671    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.85 
 
 		 636 aa  648    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  52.48 
 
 		 635 aa  652    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  53.53 
 
 		 651 aa  678    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.62 
 
 		 640 aa  643    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  52.62 
 
 		 640 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  66.82 
 
 		 659 aa  901    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.62 
 
 		 640 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  52.23 
 
 		 640 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  52.11 
 
 		 650 aa  648    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  49.93 
 
 		 686 aa  645    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  53.21 
 
 		 642 aa  659    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  52.51 
 
 		 628 aa  673    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  53.43 
 
 		 634 aa  643    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  66.05 
 
 		 651 aa  880    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  56.92 
 
 		 637 aa  727    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  58.5 
 
 		 643 aa  773    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  58.77 
 
 		 649 aa  771    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  59.88 
 
 		 643 aa  778    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  56.03 
 
 		 635 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  52.9 
 
 		 642 aa  663    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  51.47 
 
 		 655 aa  652    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  50.39 
 
 		 655 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  52.38 
 
 		 660 aa  658    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  77.23 
 
 		 645 aa  1069    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  54.84 
 
 		 640 aa  663    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  50.77 
 
 		 644 aa  634  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 		 647 aa  635  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  51.76 
 
 		 649 aa  631  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  50.74 
 
 		 675 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  50.74 
 
 		 675 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 		 643 aa  635  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  50.74 
 
 		 675 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  50.44 
 
 		 685 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  51.91 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  51.01 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  50.45 
 
 		 714 aa  629  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>