More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1440 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 426 aa  880    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  75.35 
 
 		 425 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  71.13 
 
 		 425 aa  655    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  65.81 
 
 		 426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  62.17 
 
 		 420 aa  559  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  63.83 
 
 		 419 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  62.12 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  62.21 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  56.9 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  55.92 
 
 		 447 aa  478  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  53.41 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  54.74 
 
 		 449 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  52.94 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  52.24 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  51.89 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  52.9 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  52.1 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  52.15 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  52 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 439 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  47.89 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  47.28 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  46.96 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  47.24 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  48.33 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  48.33 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  45.86 
 
 		 427 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  45.56 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  47.79 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.09 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  45.24 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  45.81 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  44.55 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  47.3 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  46.46 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  44.79 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  47.53 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  46.12 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  45.77 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  44.87 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  47.7 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  46.78 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  44.65 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  47.49 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  45.77 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  45.99 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  44.83 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  42.26 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  44.83 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  46.19 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  44.8 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  44.83 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  43.26 
 
 		 444 aa  368  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  44.58 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  44.31 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  44.08 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  44.58 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  45.03 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  44.21 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  44.09 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  45.2 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  43.74 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  44.68 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  43.71 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  43.06 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  44.42 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  46.46 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  44 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 443 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  45.52 
 
 		 437 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  44 
 
 		 437 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  43.76 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  43.74 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  43.76 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2757  recombination factor protein RarA  42.92 
 
 		 511 aa  363  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  45.14 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  45.82 
 
 		 456 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  46.04 
 
 		 436 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  46.78 
 
 		 505 aa  362  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  45.8 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  43.76 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>