298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1438 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  100 
 
 
683 aa  1385    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  52.05 
 
 
584 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  42.52 
 
 
533 aa  293  6e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  37.28 
 
 
527 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  41.22 
 
 
504 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  32.5 
 
 
496 aa  190  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  34.97 
 
 
501 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  33.72 
 
 
495 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  35.69 
 
 
479 aa  182  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  34.19 
 
 
516 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  32.45 
 
 
497 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  39.91 
 
 
462 aa  178  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  41.1 
 
 
432 aa  177  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  39.34 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  31.72 
 
 
584 aa  174  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  43.56 
 
 
534 aa  173  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  31.71 
 
 
516 aa  173  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  38.72 
 
 
444 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  39.04 
 
 
490 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  35.1 
 
 
566 aa  171  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  40.17 
 
 
539 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  40.17 
 
 
539 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  40.17 
 
 
539 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  37.24 
 
 
451 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  40.17 
 
 
539 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  38.34 
 
 
491 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  31.95 
 
 
499 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  39.67 
 
 
461 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  33.06 
 
 
507 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  37.71 
 
 
446 aa  168  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  37.02 
 
 
500 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  37.71 
 
 
446 aa  168  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  36.33 
 
 
463 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  39.44 
 
 
461 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  38.25 
 
 
490 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  38.49 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  34.83 
 
 
558 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  33.63 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  39.04 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  37.45 
 
 
489 aa  165  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  39.04 
 
 
461 aa  165  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  39.04 
 
 
461 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  39.04 
 
 
461 aa  165  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  39.04 
 
 
461 aa  165  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  38.25 
 
 
461 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  39.04 
 
 
461 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  37.85 
 
 
489 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  37.85 
 
 
489 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  38.89 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  44.13 
 
 
463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  38.89 
 
 
461 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  38.65 
 
 
461 aa  164  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  38.89 
 
 
461 aa  164  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  39.57 
 
 
471 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  37.05 
 
 
489 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  34.96 
 
 
509 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  35.5 
 
 
324 aa  160  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  31.23 
 
 
510 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  31.93 
 
 
517 aa  159  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  34.73 
 
 
501 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  30.55 
 
 
544 aa  158  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  34.23 
 
 
498 aa  157  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  31.75 
 
 
517 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  30.28 
 
 
510 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  32.64 
 
 
512 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  32.64 
 
 
512 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  29.43 
 
 
544 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  40.33 
 
 
464 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  29.45 
 
 
497 aa  153  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  39.3 
 
 
497 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  29.12 
 
 
501 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  42.29 
 
 
449 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  42.29 
 
 
449 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  42.29 
 
 
395 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  34.6 
 
 
501 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  31.12 
 
 
482 aa  152  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  34.22 
 
 
501 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  34.22 
 
 
501 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  39.32 
 
 
452 aa  151  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  39.32 
 
 
452 aa  151  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  42.29 
 
 
449 aa  150  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0685  di-/tripeptide transporter  41.38 
 
 
351 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.284877  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  34.86 
 
 
490 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  30.21 
 
 
483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  41.85 
 
 
449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  30.68 
 
 
498 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  36.05 
 
 
517 aa  147  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  39.92 
 
 
463 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  29.4 
 
 
497 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  35.62 
 
 
516 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  32.36 
 
 
501 aa  144  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  32.36 
 
 
501 aa  144  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  30.47 
 
 
493 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  31.72 
 
 
485 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  31.42 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  30.77 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  31.42 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  31.42 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  30.77 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  30.77 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>