18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1258 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  100 
 
 
375 aa  773    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  37.16 
 
 
390 aa  242  9e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  36.34 
 
 
402 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  34.55 
 
 
391 aa  219  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  35.38 
 
 
392 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  31.5 
 
 
383 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  35.96 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  30.49 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  30.46 
 
 
390 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  32.22 
 
 
386 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  29.94 
 
 
400 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  27.54 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  24.41 
 
 
386 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.41 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.25 
 
 
421 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  29.41 
 
 
421 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0428  OMPP1/FadL/TodX family toluene transport protein  25.13 
 
 
422 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  26.5 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>