More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1219 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  100 
 
 		 299 aa  609  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  60.74 
 
 		 298 aa  378  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.39 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  52.63 
 
 		 303 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  50 
 
 		 305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  50.33 
 
 		 305 aa  301  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  57.89 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  44.19 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  56.82 
 
 		 235 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  46.35 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  42.57 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 322 aa  244  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  42.43 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  42.14 
 
 		 316 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  41.29 
 
 		 315 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  42.54 
 
 		 315 aa  234  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  50.9 
 
 		 240 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  40.53 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  39.94 
 
 		 336 aa  232  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  42.72 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 314 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  40.85 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.09 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  38.94 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  39.54 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 		 307 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  38.69 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 312 aa  217  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  37.5 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.26 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  36.57 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  37.54 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  38.19 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  38.19 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  36.31 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  47 
 
 		 261 aa  209  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  35.43 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  36.33 
 
 		 328 aa  206  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  35.41 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  36.81 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  36.98 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  37.1 
 
 		 341 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  45.5 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  37.37 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.17 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  34.87 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  35.33 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  35.67 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  42.92 
 
 		 247 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  36.09 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  34.01 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.2 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.14 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.55 
 
 		 337 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  38.21 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  33.77 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  35.5 
 
 		 314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  33.12 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  41.86 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.43 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  33.66 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.49 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.21 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  37.66 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.95 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.76 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  37.46 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 241 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  34.77 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.89 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  34.56 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  32.13 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  36.21 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  39.23 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.9 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  31.58 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  41.36 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.11 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  38.65 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>