More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1163 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  100 
 
 		 118 aa  233  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  68.64 
 
 		 116 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  65.22 
 
 		 117 aa  157  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  72.88 
 
 		 117 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  63.11 
 
 		 117 aa  140  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  61.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  60.91 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  61.86 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  59.65 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  59.17 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  59.17 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  59.32 
 
 		 116 aa  133  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  62.83 
 
 		 120 aa  133  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 120 aa  131  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  57.39 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  55 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  58.93 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  55.36 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 		 119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  56.36 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000151304  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  48.36 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  62.63 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  56.6 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  57.39 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  58.65 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  57.14 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  53.57 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  59.43 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  55.66 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  61.17 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  55.66 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  54.87 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  55.66 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  57.94 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  53.98 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  54.03 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  53.04 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  54.63 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  60.61 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  60.61 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  59.6 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  57.69 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0426216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>