101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1100 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  100 
 
 
205 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1821  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  47.21 
 
 
203 aa  196  2e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0706  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  43.2 
 
 
177 aa  147  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000199981  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1893  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  42.97 
 
 
174 aa  113  2e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0693886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  34.44 
 
 
151 aa  108  4e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  34.78 
 
 
151 aa  108  4e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4235  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  38.06 
 
 
161 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4607  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  36.02 
 
 
158 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  34.44 
 
 
151 aa  107  8e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2867  cytochrome c nitrite reductase  38.3 
 
 
177 aa  107  9e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2399  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  34.48 
 
 
153 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.524559  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0295  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  34.03 
 
 
153 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.97678e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0130  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  34.75 
 
 
180 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1979  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  34.73 
 
 
172 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1023  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  35.95 
 
 
164 aa  100  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.127457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1043  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  33.76 
 
 
161 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00711927  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0340  cytochrome c-type protein nrfH  36.77 
 
 
171 aa  98.2  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.349319  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3707  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  32.91 
 
 
152 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.741906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0956  cytochrome c-type protein  34.69 
 
 
150 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.394996  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1547  cytochrome c-type protein nrfH  36.13 
 
 
171 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1360  cytochrome c-type protein nrfH  36.13 
 
 
171 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1243  cytochrome c-type protein NrfH  34.87 
 
 
166 aa  94  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0664  hypothetical protein  32.89 
 
 
154 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0964  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  35.82 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0961  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  35.82 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0911  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  35.82 
 
 
151 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1199  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  34.43 
 
 
154 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0700  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  38.84 
 
 
153 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3155  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  34.17 
 
 
134 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3630  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH  31.61 
 
 
166 aa  79.3  4e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.85954e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2096  NapC/NirT cytochrome c family protein  32.26 
 
 
158 aa  74.3  1e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.999464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2386  cytochrome c nitrite reductase small subunit  32.28 
 
 
158 aa  72  5e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2334  NapC/NirT cytochrome c family protein  32.45 
 
 
159 aa  71.2  1e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000913356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1522  cytochrome c nitrite reductase small subunit NrfH  31.9 
 
 
125 aa  70.9  1e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0082  NapC/NirT cytochrome c family protein  28.75 
 
 
155 aa  68.2  9e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0799  putative tetraheme cytochrome c  26.22 
 
 
183 aa  67  2e-10  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  1.22582e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1446  NapC/NirT cytochrome c domain protein  25.73 
 
 
206 aa  65.5  5e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.148629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1491  cytochrome c nitrite reductase small subunit  31.01 
 
 
159 aa  63.9  2e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2086  NapC/NirT cytochrome c domain protein  28.32 
 
 
210 aa  58.9  4e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  28.4 
 
 
378 aa  58.2  1e-07  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1551  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  28.82 
 
 
190 aa  56.2  3e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1831  NapC/NirT cytochrome c family, N- region  25.45 
 
 
234 aa  56.2  4e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  27.95 
 
 
200 aa  55.1  8e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  27.95 
 
 
200 aa  54.3  1e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1635  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.71 
 
 
180 aa  52.4  4e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  6.71983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  27.66 
 
 
200 aa  52  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  27.66 
 
 
200 aa  52  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  27.66 
 
 
200 aa  52  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  27.66 
 
 
200 aa  52  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  27.66 
 
 
200 aa  52  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2384  NapC/NirT cytochrome c domain protein  26.22 
 
 
185 aa  52  7e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0435  putative tetraheme cytochrome c  28.14 
 
 
190 aa  51.6  8e-06  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0127552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  28.12 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  28.12 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  28.12 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  28.12 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  28.12 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  28.12 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  28.12 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  28.12 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  28.12 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3161  cytochrome c-type protein NapC  27.6 
 
 
237 aa  50.1  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  27.51 
 
 
200 aa  50.1  2e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  27.51 
 
 
199 aa  50.1  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  27.51 
 
 
199 aa  50.1  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2579  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  26.86 
 
 
191 aa  49.3  4e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123088  normal  0.367368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0299  trimethylamine N-oxide reductase, cytochrome c-type subunit  25.9 
 
 
188 aa  49.3  4e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.649247  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0138  putative tetraheme cytochrome c  24.46 
 
 
190 aa  48.5  6e-05  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.01 
 
 
386 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  4.48194e-07 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3773  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  27.43 
 
 
392 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4034  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25 
 
 
394 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25 
 
 
394 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25 
 
 
394 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25 
 
 
394 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4155  cytochrome c-type protein torC  25 
 
 
394 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3046  DMSO/TMAO pentaheme cytochrome c subunit  27.43 
 
 
392 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3199  hypothetical protein  29.63 
 
 
507 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00139796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  25.57 
 
 
195 aa  45.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2617  NapC/NirT cytochrome c domain protein  25.52 
 
 
203 aa  45.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1063  hypothetical protein  28.36 
 
 
507 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27837e-22 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  23.49 
 
 
366 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3218  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.49 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  23.53 
 
 
390 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.53 
 
 
390 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.53 
 
 
390 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  23.53 
 
 
390 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3484  cytochrome c-type protein NapC  29.41 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0382018  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  23.53 
 
 
390 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  23.53 
 
 
390 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  25 
 
 
364 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1339  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  24.74 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0861  hypothetical protein  27.13 
 
 
507 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.62424e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  29.27 
 
 
287 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  23.26 
 
 
364 aa  42  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25.31 
 
 
411 aa  42  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.460429  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3513  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  24.84 
 
 
215 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.654609  normal  0.0192355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1338  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  24.34 
 
 
202 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2077  hypothetical protein  26.67 
 
 
260 aa  41.6  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4005  NapC/NirT cytochrome c domain protein  26.83 
 
 
206 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1055  cytochrome c-type protein NapC  27.06 
 
 
195 aa  41.2  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>