More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1006 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  100 
 
 		 324 aa  668    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  61.85 
 
 		 325 aa  425  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  59.38 
 
 		 325 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  45.54 
 
 		 323 aa  309  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  42.55 
 
 		 286 aa  257  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  34.56 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  42.19 
 
 		 223 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  33 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.42 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  38.39 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  48.51 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  48.46 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  31.37 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  34.17 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  38.12 
 
 		 274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  40 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  51.69 
 
 		 377 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  40.74 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  42.05 
 
 		 569 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  48.85 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  37.82 
 
 		 247 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  50.85 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  36.73 
 
 		 387 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  49.62 
 
 		 229 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  42.59 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.59 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  37.65 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  36.79 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  40.46 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  51.75 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  41.61 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  41.98 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45.19 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  41.61 
 
 		 445 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  41.62 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  50.88 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  50.88 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  43.92 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.32 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  46.15 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  42.07 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  37 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  36.41 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  39.6 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  48.28 
 
 		 399 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  48.28 
 
 		 399 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  39.89 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  31.76 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  41.83 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  47.11 
 
 		 527 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  50.86 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  28.95 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.19 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  49.12 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  41.33 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  44.12 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  45.11 
 
 		 455 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  39.88 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  33.2 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  42.76 
 
 		 243 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  50.86 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.93 
 
 		 453 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.97 
 
 		 248 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  40.26 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.72 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  39.02 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  43.4 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  31.02 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  49.14 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  46.4 
 
 		 533 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  50.86 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  40.11 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  40.46 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  49.56 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  30.39 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  37.28 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  52.21 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  40.38 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  35.54 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50 
 
 		 379 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  50.86 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  46.55 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.22 
 
 		 423 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  48.21 
 
 		 441 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  47.69 
 
 		 288 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  45.19 
 
 		 455 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.31 
 
 		 524 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  37.5 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  31.3 
 
 		 687 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  40.13 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  44.2 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  42.94 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  44.36 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  38.92 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  39.13 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  31.8 
 
 		 676 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  42.04 
 
 		 443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  40.82 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  47.32 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  37.63 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>