42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0989 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  249  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  64 
 
 		 125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  57.14 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  64.6 
 
 		 116 aa  143  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  61.34 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  58.82 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  54.4 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  52.29 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  47.93 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  47.37 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  42.98 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  48.74 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  49.12 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  52.04 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  37.93 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  52.11 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  30.33 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  33.63 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  33.93 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  37.27 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  29.63 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  28.97 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  34.23 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  36.26 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  55.56 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  31.78 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  31.78 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  31.78 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  31.78 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  31.13 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1843  S23 ribosomal protein  35.05 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.561977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  30.26 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1181  S23 ribosomal protein  29.76 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  22.52 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3082  hypothetical protein  34.07 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2487  S23 ribosomal protein  25.49 
 
 		 130 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  30.91 
 
 		 117 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  24.55 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>