13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0925 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0925  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  249  8.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000524962  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1294  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.886265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5434  hypothetical protein  43.88 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5131  hypothetical protein  43.14 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3710  hypothetical protein  42.74 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1031  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1721  hypothetical protein  33.68 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3187  hypothetical protein  29.63 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  37.5 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1506  hypothetical protein  30.56 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0140  hypothetical protein  34.94 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0804  hypothetical protein  32.94 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1646  hypothetical protein, putative phage gene  32.14 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>