More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0912 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0819  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.75 
 
 		 503 aa  890    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 462 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3763  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.86 
 
 		 504 aa  791    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 476 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0912  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 504 aa  1019    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 482 aa  651    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 462 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.39 
 
 		 478 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.12 
 
 		 462 aa  643    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01410  ATP synthase subunit B  87.32 
 
 		 501 aa  890    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.13 
 
 		 462 aa  651    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.33 
 
 		 476 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.06 
 
 		 481 aa  646    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7073  ATP synthase F1, beta subunit  76.14 
 
 		 500 aa  782    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.92 
 
 		 493 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.33 
 
 		 476 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 		 476 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.33 
 
 		 476 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.99 
 
 		 476 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.01 
 
 		 513 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 		 519 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0336  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.49 
 
 		 501 aa  800    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.5 
 
 		 465 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.5 
 
 		 465 aa  636    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 480 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.52 
 
 		 462 aa  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5125  ATP synthase F1, beta subunit  75.85 
 
 		 508 aa  775    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.2 
 
 		 478 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0073  ATP synthase F1, beta subunit  73.95 
 
 		 501 aa  741    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0925  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.65 
 
 		 502 aa  761    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0113019 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 462 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3415  ATP synthase F1, beta subunit  78.69 
 
 		 500 aa  805    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 484 aa  634  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.65 
 
 		 484 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.86 
 
 		 464 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.86 
 
 		 475 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.86 
 
 		 475 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.45 
 
 		 482 aa  631  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 462 aa  634  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.05 
 
 		 484 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.33 
 
 		 476 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  65.31 
 
 		 530 aa  629  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.27 
 
 		 468 aa  628  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  63.93 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 		 484 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.46 
 
 		 475 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.27 
 
 		 468 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.46 
 
 		 474 aa  629  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.91 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.73 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.53 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.53 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.76 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.07 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.14 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.14 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.14 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.34 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.75 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 485 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1744  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 485 aa  626  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  0.184526 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.14 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.66 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.73 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4106  ATP synthase F1, beta subunit  66.39 
 
 		 485 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.76 
 
 		 473 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.07 
 
 		 468 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 517 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.33 
 
 		 537 aa  621  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  65.85 
 
 		 465 aa  624  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 		 474 aa  624  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.68 
 
 		 472 aa  624  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.21 
 
 		 479 aa  622  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  64.52 
 
 		 501 aa  619  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.6 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.8 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.73 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3941  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.45 
 
 		 478 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.77 
 
 		 465 aa  619  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.66 
 
 		 474 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.87 
 
 		 475 aa  621  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.07 
 
 		 481 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.37 
 
 		 480 aa  621  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  64.52 
 
 		 518 aa  615  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.64 
 
 		 484 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.9 
 
 		 521 aa  615  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.9 
 
 		 521 aa  615  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  62.85 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 474 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3652  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.45 
 
 		 478 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0343  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.98 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050058 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.1 
 
 		 504 aa  617  1e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.07 
 
 		 542 aa  617  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  62.99 
 
 		 547 aa  614  9.999999999999999e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.02 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.92 
 
 		 475 aa  610  1e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.12 
 
 		 507 aa  609  1e-173  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>