247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0911 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0911  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  100 
 
 
78 aa  155  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0818  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  45.16 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  42.31 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2015  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.42 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0028  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  42.11 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7072  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  39.74 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.689202  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3416  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  47.44 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0337  H+-transporting two-sector ATPase, epsilon subunit  44.87 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01405  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.78 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.913461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3764  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.59 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0047  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.42 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0020  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.11 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0048  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  39.47 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0030  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  42.11 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00561191  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.03 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.18 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0049  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.16 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.116999  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.47 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.47 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.79 
 
 
140 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.47 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.79 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.47 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1028  hypothetical protein  35.9 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1402  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.89 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  34.67 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  42.5 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.67 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.66 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.53 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.71 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.53 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.18 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2377  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.84 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1682  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.89 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87905  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.21 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0688  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.5 
 
 
130 aa  52  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0115  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.17 
 
 
138 aa  52  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3021  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.82 
 
 
149 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
142 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
142 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.18 
 
 
152 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4506  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
142 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.107248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.33 
 
 
133 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4874  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.18 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4364  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
142 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.788281  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.77 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0001138  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.53 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0143  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.53 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000440039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4365  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.18 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.53 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.89 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.33 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.9 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  34.62 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.53 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1312  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.21 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0997664  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.21 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.21 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3202  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.89 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.447549  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0198  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.47 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2806  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.89 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.668633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6355  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.67 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.16 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  32 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.95 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.26 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73230  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.67 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.95 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.62 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1800  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.21 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502028  normal  0.0883001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.99 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  35.53 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.39 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>