More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0842 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 		 853 aa  649    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 		 896 aa  676    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 858 aa  684    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 		 871 aa  723    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  55.19 
 
 		 891 aa  995    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  46.23 
 
 		 871 aa  754    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 891 aa  658    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  41.9 
 
 		 894 aa  651    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  58.14 
 
 		 864 aa  1013    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 881 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  55.83 
 
 		 863 aa  997    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  45.2 
 
 		 878 aa  745    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 860 aa  1780    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 872 aa  697    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.62 
 
 		 900 aa  659    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 		 869 aa  704    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 		 870 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  72.55 
 
 		 869 aa  1310    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  45.78 
 
 		 873 aa  731    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44.42 
 
 		 872 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 873 aa  651    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  59.67 
 
 		 858 aa  1055    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 		 872 aa  707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 		 870 aa  687    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 		 863 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  57.81 
 
 		 868 aa  1036    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 		 858 aa  679    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.7 
 
 		 887 aa  707    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  47.97 
 
 		 875 aa  801    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 		 867 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 882 aa  669    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  70.74 
 
 		 855 aa  1259    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 837 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  51.66 
 
 		 898 aa  851    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  45.37 
 
 		 872 aa  739    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  58.01 
 
 		 856 aa  1027    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 		 862 aa  667    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  42.46 
 
 		 858 aa  693    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41 
 
 		 859 aa  654    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  45.59 
 
 		 872 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  58.23 
 
 		 886 aa  1042    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 868 aa  669    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 869 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 		 932 aa  672    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 857 aa  667    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 889 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 		 868 aa  670    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 870 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  40.21 
 
 		 828 aa  633  1e-180  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 868 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 		 848 aa  630  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 		 863 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 872 aa  623  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 910 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  40.59 
 
 		 910 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 		 823 aa  620  1e-176  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 		 874 aa  618  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  39.6 
 
 		 897 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  39.14 
 
 		 880 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 		 854 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42.36 
 
 		 850 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 860 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 		 859 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  39.43 
 
 		 863 aa  611  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 854 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  39.51 
 
 		 854 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 		 855 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 865 aa  607  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 855 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 		 854 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 		 855 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 863 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 855 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 		 855 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 882 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 855 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  39.51 
 
 		 854 aa  602  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  38.8 
 
 		 871 aa  600  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 882 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 907 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 		 856 aa  602  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 		 852 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 		 872 aa  598  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  37.98 
 
 		 928 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 		 855 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 882 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 882 aa  596  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 		 853 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 851 aa  598  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  39.41 
 
 		 851 aa  594  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 854 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  39.41 
 
 		 851 aa  595  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.07 
 
 		 887 aa  593  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  39.41 
 
 		 851 aa  595  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 		 862 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 861 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 896 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 861 aa  595  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 		 884 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 		 884 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>