More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0819 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  62.39 
 
 		 549 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  62.57 
 
 		 549 aa  698    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 539 aa  1112    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  60.51 
 
 		 552 aa  686    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  62.27 
 
 		 550 aa  699    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  56.67 
 
 		 550 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  59.89 
 
 		 550 aa  674    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  57.2 
 
 		 548 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  67.53 
 
 		 545 aa  744    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  63 
 
 		 550 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  61.28 
 
 		 549 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  62.39 
 
 		 549 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  62.39 
 
 		 549 aa  697    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  61.54 
 
 		 549 aa  690    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  61.28 
 
 		 549 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  61.47 
 
 		 549 aa  683    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  61.28 
 
 		 549 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  61.65 
 
 		 548 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  61.1 
 
 		 549 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  62.39 
 
 		 549 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  60.99 
 
 		 550 aa  673    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  57.51 
 
 		 553 aa  644    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  61.65 
 
 		 548 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  70.17 
 
 		 547 aa  809    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  60.92 
 
 		 549 aa  677    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  61.24 
 
 		 549 aa  686    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  60.48 
 
 		 567 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  61.9 
 
 		 549 aa  700    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  62.39 
 
 		 549 aa  697    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  61.1 
 
 		 548 aa  691    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  62.96 
 
 		 550 aa  702    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  61.28 
 
 		 549 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  58.87 
 
 		 550 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  62.39 
 
 		 549 aa  697    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  62.39 
 
 		 549 aa  696    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  62.39 
 
 		 549 aa  697    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  58.14 
 
 		 550 aa  634    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  61.65 
 
 		 548 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  61.54 
 
 		 548 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  61.1 
 
 		 549 aa  680    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  56.9 
 
 		 547 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  55.76 
 
 		 548 aa  625  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  57.94 
 
 		 559 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  56.48 
 
 		 548 aa  618  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  56.22 
 
 		 552 aa  617  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  56.22 
 
 		 562 aa  616  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  56.48 
 
 		 549 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  54.55 
 
 		 546 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  55.95 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  55.08 
 
 		 549 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  55.08 
 
 		 541 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  54.34 
 
 		 547 aa  602  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  52.51 
 
 		 548 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  54.9 
 
 		 547 aa  596  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  51.78 
 
 		 543 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  54.93 
 
 		 546 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  51.79 
 
 		 649 aa  587  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  51.78 
 
 		 543 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  53.09 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  54.86 
 
 		 531 aa  581  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  50.83 
 
 		 550 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  51.03 
 
 		 546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  50.84 
 
 		 546 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  51.21 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  51.11 
 
 		 545 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  51.48 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  51.75 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  50.93 
 
 		 547 aa  566  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  51.12 
 
 		 550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  51.1 
 
 		 548 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  50.56 
 
 		 545 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  53.1 
 
 		 556 aa  557  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  51.65 
 
 		 561 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 545 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  51.39 
 
 		 540 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  51.3 
 
 		 545 aa  555  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  48.89 
 
 		 554 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 545 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  48.89 
 
 		 554 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 540 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  51.77 
 
 		 545 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  48.89 
 
 		 554 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 545 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 540 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  48.51 
 
 		 541 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 556 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 556 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 556 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 549 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 540 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 540 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 540 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 545 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 545 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  49.09 
 
 		 553 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  47.87 
 
 		 553 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 540 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>