More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0715 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  51.83 
 
 
203 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  50.78 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  40.82 
 
 
218 aa  158  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.93 
 
 
209 aa  150  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  40.1 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  38.19 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  39.56 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  33.85 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  33.67 
 
 
220 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  34.38 
 
 
211 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  37.82 
 
 
214 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  32.98 
 
 
198 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  37.63 
 
 
204 aa  101  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  30.53 
 
 
209 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  36.51 
 
 
210 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  31.05 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  31.28 
 
 
213 aa  95.5  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  32.64 
 
 
371 aa  94.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  28.8 
 
 
212 aa  94.4  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  31.47 
 
 
227 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  33.51 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  26.49 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  29.65 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  29.08 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  32.99 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  32.99 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  26.11 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  33.53 
 
 
214 aa  91.3  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  30.27 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  33.16 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  31.96 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  31.44 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  31.44 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  30.9 
 
 
296 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  30.81 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  45.92 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  27.5 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  30.32 
 
 
174 aa  84.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  29.57 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  29.74 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  33.76 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  31.48 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  30.57 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  32.8 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  30.32 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  26.18 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  25.89 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  26.02 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  30.85 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  36 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  28.43 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  30.53 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  27.6 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  24.58 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  31.61 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  27.89 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  24.44 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  24.74 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  31.11 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  31.41 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  31.94 
 
 
181 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  30.05 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  24.74 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  26.13 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.71 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  25.48 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  29.81 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  23.86 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  30.29 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  22.92 
 
 
223 aa  67.8  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.79 
 
 
218 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  28.65 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  30.16 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.09 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  29.82 
 
 
214 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  32.28 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  38.14 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  25.62 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  23.04 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  37 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  37.11 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  22.92 
 
 
365 aa  64.7  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  32.73 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  25.26 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1466  hypothetical protein  24.35 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0046355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0194  hypothetical protein  24.64 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  30.22 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  25 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  25.65 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  23.4 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  23.32 
 
 
226 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  28.06 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0192  transferase, putative  24.88 
 
 
209 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0496333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  26.42 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  24.48 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5367  hexapaptide repeat-containing transferase  25.13 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  24.43 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  29.68 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2311  hexapaptide repeat-containing transferase  22.58 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0450903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>