More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0670 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 
207 aa  425  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  54.59 
 
 
214 aa  231  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  56.06 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  52.74 
 
 
227 aa  218  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  50.72 
 
 
219 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  49.51 
 
 
216 aa  203  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  47.83 
 
 
219 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  49.76 
 
 
218 aa  198  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  50.75 
 
 
219 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  46 
 
 
215 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  46.19 
 
 
221 aa  174  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  44.98 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  45.6 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  43 
 
 
220 aa  168  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  46.53 
 
 
965 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  40.59 
 
 
209 aa  164  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  44.74 
 
 
216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  41.63 
 
 
220 aa  160  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  41.54 
 
 
219 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  44.39 
 
 
230 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  42.5 
 
 
986 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  42.19 
 
 
219 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  44.1 
 
 
214 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  40.29 
 
 
219 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  39.81 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  39.81 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  42.19 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  41.67 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  39.81 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  44.06 
 
 
978 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  39.32 
 
 
219 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  41.36 
 
 
215 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  39.32 
 
 
219 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  47.21 
 
 
220 aa  147  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  39.47 
 
 
585 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  37.32 
 
 
228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  39.39 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  38.73 
 
 
223 aa  136  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  38.54 
 
 
220 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  36.76 
 
 
456 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.96 
 
 
223 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  35.96 
 
 
456 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  34.98 
 
 
456 aa  115  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.87 
 
 
225 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.71 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.95 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.79 
 
 
231 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.82 
 
 
233 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  32.37 
 
 
219 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  33.86 
 
 
188 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
221 aa  101  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.59 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.83 
 
 
224 aa  98.6  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.43 
 
 
250 aa  98.2  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.94 
 
 
202 aa  97.8  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  30.93 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.92 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  32.88 
 
 
248 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  31.22 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.38 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  35.78 
 
 
242 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.54 
 
 
260 aa  95.5  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.48 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  34.04 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  32.46 
 
 
188 aa  94.7  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  32.46 
 
 
188 aa  94.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  32.46 
 
 
188 aa  94.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.32 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.5 
 
 
230 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30 
 
 
396 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.3 
 
 
252 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.95 
 
 
1051 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.65 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.29 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  36.08 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.17 
 
 
222 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  32.24 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.01 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.82 
 
 
1053 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.28 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  31.91 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.91 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  30.61 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
216 aa  92.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.9 
 
 
1051 aa  92.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  31.91 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.14 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.9 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.91 
 
 
253 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
269 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>