19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0509 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0509  hypothetical protein  100 
 
 
547 aa  1117    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0663  hypothetical protein  44.55 
 
 
562 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01725  hypothetical protein  39.71 
 
 
537 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0332705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0010  hypothetical protein  29.76 
 
 
542 aa  203  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3804  hypothetical protein  28.05 
 
 
538 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.387517  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0895  hypothetical protein  42.01 
 
 
491 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.686581  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0081  hypothetical protein  36.36 
 
 
725 aa  133  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3301  hypothetical protein  30.33 
 
 
586 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137891  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0216  hypothetical protein  30.66 
 
 
271 aa  99.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1499  hypothetical protein  30.66 
 
 
271 aa  99.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3504  hypothetical protein  30.88 
 
 
518 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  30.22 
 
 
555 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1809  hypothetical protein  23.31 
 
 
376 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.895599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2021  hypothetical protein  27.14 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0664622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0329  hypothetical protein  24.03 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0179467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2190  hypothetical protein  29.73 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  26.5 
 
 
342 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2247  hypothetical protein  28.86 
 
 
570 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0219  hypothetical protein  24.07 
 
 
569 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>