More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0473 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  100 
 
 		 824 aa  1680    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  37.55 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  35.93 
 
 		 830 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  34.53 
 
 		 800 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  32.58 
 
 		 812 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  31.84 
 
 		 830 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  30.76 
 
 		 791 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  33.71 
 
 		 846 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 1055 aa  301  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 828 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.54 
 
 		 781 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 828 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 948 aa  294  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  28.79 
 
 		 827 aa  291  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  30.64 
 
 		 936 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  29.18 
 
 		 952 aa  280  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 837 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 837 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 833 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 828 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  29.88 
 
 		 837 aa  273  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  29.06 
 
 		 834 aa  273  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  28.2 
 
 		 833 aa  272  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  27.86 
 
 		 869 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  26.63 
 
 		 940 aa  244  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  31.29 
 
 		 947 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  26.31 
 
 		 977 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.52 
 
 		 852 aa  234  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  26.72 
 
 		 869 aa  211  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.43 
 
 		 919 aa  210  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.11 
 
 		 920 aa  207  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  26.22 
 
 		 910 aa  206  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.19 
 
 		 919 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  27.61 
 
 		 920 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 912 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  26.11 
 
 		 922 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  24.02 
 
 		 869 aa  191  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 931 aa  190  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 915 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  24.28 
 
 		 897 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 753 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  28.26 
 
 		 779 aa  181  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.19 
 
 		 877 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 921 aa  177  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.14 
 
 		 877 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.92 
 
 		 800 aa  174  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.71 
 
 		 875 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.29 
 
 		 568 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.46 
 
 		 576 aa  170  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  28.09 
 
 		 803 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 849 aa  164  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  25.42 
 
 		 609 aa  121  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  39.19 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  26.72 
 
 		 606 aa  112  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  25.34 
 
 		 579 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 478 aa  110  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  24.41 
 
 		 580 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  24.15 
 
 		 552 aa  109  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  24.2 
 
 		 552 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  23.96 
 
 		 552 aa  107  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  23.17 
 
 		 605 aa  98.2  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  32.97 
 
 		 565 aa  96.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  25.23 
 
 		 558 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  26.9 
 
 		 552 aa  95.5  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  24.23 
 
 		 992 aa  94  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  24.77 
 
 		 558 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  24.77 
 
 		 558 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 557 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  23.61 
 
 		 603 aa  89  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  27.42 
 
 		 606 aa  88.2  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 573 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 587 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  25.31 
 
 		 992 aa  83.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  26.29 
 
 		 362 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  26.36 
 
 		 700 aa  80.1  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.36 
 
 		 703 aa  80.1  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  27.94 
 
 		 282 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  26.94 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.9 
 
 		 700 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 392 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.72 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.19 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  24.52 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  26.2 
 
 		 264 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 283 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 282 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 392 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 281 aa  70.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  27.24 
 
 		 386 aa  70.5  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 387 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 387 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  27.2 
 
 		 268 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  28.51 
 
 		 298 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>