More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0454 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  57.63 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  63.31 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  51.41 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  45.41 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  47.2 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  45.24 
 
 		 211 aa  144  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  43.65 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  47.52 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  34.91 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  37.57 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  37.59 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.57 
 
 		 243 aa  97.1  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  40.38 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 213 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  35.43 
 
 		 192 aa  94.4  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  36.16 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  36.16 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  36.16 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  36.16 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  36.16 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.97 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  44.03 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  40.77 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.18 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.16 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  35.57 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.16 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  43.57 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  40.15 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  43.57 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  35.15 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  35.59 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  39.55 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  40.91 
 
 		 226 aa  91.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 204 aa  91.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  35.39 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  39.72 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  35.97 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  40 
 
 		 172 aa  90.9  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.97 
 
 		 231 aa  90.9  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  35.29 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  32.43 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  36.05 
 
 		 282 aa  88.2  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  35.25 
 
 		 225 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  36.76 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 		 209 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  36.36 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  34.72 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  33.99 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  33.9 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  30.77 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  35.56 
 
 		 238 aa  84.7  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  34.44 
 
 		 221 aa  84.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  39.1 
 
 		 213 aa  84.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  36.81 
 
 		 207 aa  84.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  35.97 
 
 		 184 aa  84.7  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  31.55 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  40.15 
 
 		 197 aa  84.3  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  34.81 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  37.5 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  36.57 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  33.53 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  33.33 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  31.52 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  34.72 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  35.46 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  31.22 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  32.37 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  31.55 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  37.5 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  37.67 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  32.59 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.59 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  32.77 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  31.76 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1196  GrpE protein  34.36 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.77 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0096  heat shock protein GrpE  33.7 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  34.06 
 
 		 286 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.58 
 
 		 248 aa  77.8  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.96 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  32.59 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  35.17 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  35.51 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  31.18 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.52 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  39.1 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>