40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0446 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  34.85 
 
 
217 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  32.49 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  31.63 
 
 
238 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  32.12 
 
 
268 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  28.5 
 
 
240 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  29.9 
 
 
216 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  28.09 
 
 
233 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  27.6 
 
 
248 aa  99  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  25.68 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  28.87 
 
 
197 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  31.98 
 
 
232 aa  95.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  29.69 
 
 
207 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  26.53 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  26.29 
 
 
280 aa  92.8  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  31.33 
 
 
871 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  24.37 
 
 
509 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  28.46 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  25.13 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  26.13 
 
 
1072 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  25.38 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  25.58 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  26.07 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  24.37 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 
447 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  21.83 
 
 
424 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  23.56 
 
 
261 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  23.95 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  29.32 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  26.29 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  24.14 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.33 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  27.18 
 
 
372 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  26.32 
 
 
230 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  24.77 
 
 
383 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  22.8 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  23 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.07 
 
 
265 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  35.71 
 
 
48 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  25.73 
 
 
252 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>