More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0422 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 145 aa  293  6e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  84.83 
 
 		 145 aa  259  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  87.23 
 
 		 146 aa  255  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  77.93 
 
 		 147 aa  238  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  77.24 
 
 		 147 aa  237  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  76.55 
 
 		 147 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  74.48 
 
 		 149 aa  230  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  74.31 
 
 		 145 aa  226  9e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  72.41 
 
 		 147 aa  225  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  61.15 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 146 aa  190  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  62.14 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  61.27 
 
 		 163 aa  178  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  59.29 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 142 aa  175  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 140 aa  175  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  57.97 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  56.43 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  59.86 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 140 aa  170  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  56.12 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  56.12 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1966  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 140 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 144 aa  167  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  57.45 
 
 		 141 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 141 aa  166  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  55.4 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1045  ribosomal protein L11  56.74 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  56.03 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  57.25 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  57.45 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  55.4 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  61.24 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  53.57 
 
 		 164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  54.29 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  57.55 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  54.68 
 
 		 141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>