More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0400 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
327 aa  674    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  45.79 
 
 
331 aa  325  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  46.42 
 
 
331 aa  315  6e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  44.86 
 
 
338 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  43.69 
 
 
332 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  42.95 
 
 
337 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  39.68 
 
 
326 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  38.51 
 
 
331 aa  251  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  38.59 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 
303 aa  198  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 
311 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.52 
 
 
311 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  34.11 
 
 
305 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 
302 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 
308 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  29.97 
 
 
305 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 
325 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 
293 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 
302 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 
308 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  28.17 
 
 
311 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  32.22 
 
 
304 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  33.47 
 
 
304 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 
312 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  33.2 
 
 
304 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  32.95 
 
 
295 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  29.25 
 
 
293 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  32.56 
 
 
295 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 
319 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 
317 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  31.15 
 
 
306 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 
316 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  32.06 
 
 
376 aa  143  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 
339 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 
305 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  31.84 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  32.44 
 
 
302 aa  140  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 
330 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  28.92 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  28.52 
 
 
320 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  28.37 
 
 
296 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
328 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  29.57 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  30.35 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  29.57 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  31.33 
 
 
313 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  29.2 
 
 
295 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  31.15 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  30.47 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  30.67 
 
 
295 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  30.47 
 
 
295 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  32.37 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  32.37 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.85 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  30.38 
 
 
295 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  25.91 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 
307 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  26.47 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.69 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  32.57 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 
295 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  28.83 
 
 
307 aa  116  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  24.48 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
295 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  28.23 
 
 
285 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  25.71 
 
 
318 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  26.53 
 
 
328 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 
292 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  28.39 
 
 
294 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  27.68 
 
 
312 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  25.09 
 
 
297 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 
299 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  25.3 
 
 
317 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  26.15 
 
 
298 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  27.41 
 
 
299 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  26.15 
 
 
298 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  27.91 
 
 
302 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  25.48 
 
 
297 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  27.47 
 
 
380 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 
313 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.04 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  27.11 
 
 
380 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>