More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0390 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 406 aa  813    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  54.93 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  56.16 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  44.58 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  43.53 
 
 		 406 aa  334  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  45.54 
 
 		 409 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  45.45 
 
 		 409 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  45.07 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  45.05 
 
 		 409 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  43.14 
 
 		 403 aa  328  7e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  45.39 
 
 		 409 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  42.23 
 
 		 406 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 		 409 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 		 409 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  39.85 
 
 		 409 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  38.55 
 
 		 715 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  42.18 
 
 		 658 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  40.44 
 
 		 454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  43.58 
 
 		 670 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  38.59 
 
 		 707 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  42.57 
 
 		 656 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  41.95 
 
 		 408 aa  308  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  39.9 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  40.45 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  43.32 
 
 		 657 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  40.81 
 
 		 653 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  38.06 
 
 		 403 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  41.02 
 
 		 405 aa  305  8.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  42.82 
 
 		 657 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  44.01 
 
 		 409 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  42.04 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  39.45 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  37.68 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  37.68 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  38.61 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  42.36 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  37.62 
 
 		 411 aa  292  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  40.7 
 
 		 657 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  38.38 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  40.6 
 
 		 661 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  39.75 
 
 		 647 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.98 
 
 		 644 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  37.56 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  42.58 
 
 		 409 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  38.31 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  39.7 
 
 		 412 aa  289  7e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  42.04 
 
 		 671 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  41.63 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  40.55 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  39.51 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  37.59 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  37.59 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  37.25 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.66 
 
 		 678 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  39.66 
 
 		 678 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  39.66 
 
 		 678 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  37.5 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  38.63 
 
 		 443 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  40.05 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  39.26 
 
 		 651 aa  272  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  38.25 
 
 		 400 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  34.01 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  40.49 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  39.51 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  40.49 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  37.75 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 654 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  40.87 
 
 		 410 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  42.39 
 
 		 650 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  38.08 
 
 		 653 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  38.52 
 
 		 407 aa  262  8e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  38.15 
 
 		 653 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  39.7 
 
 		 423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  38.39 
 
 		 405 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  40.1 
 
 		 647 aa  259  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  38.57 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  36.93 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 649 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  38.27 
 
 		 652 aa  256  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  40.92 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  39.61 
 
 		 656 aa  255  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.03 
 
 		 663 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  37.47 
 
 		 654 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  36.57 
 
 		 654 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  35.47 
 
 		 657 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  39.71 
 
 		 667 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.03 
 
 		 663 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  39.47 
 
 		 667 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  39.47 
 
 		 682 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  36.93 
 
 		 653 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  39.47 
 
 		 682 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  35.84 
 
 		 648 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 648 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  35.84 
 
 		 648 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  40.15 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.84 
 
 		 648 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.84 
 
 		 648 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.59 
 
 		 646 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.47 
 
 		 656 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  38.28 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>