More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0370 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
307 aa  629  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  84.69 
 
 
308 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  81.11 
 
 
309 aa  525  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.2 
 
 
310 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.38 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  75.5 
 
 
307 aa  482  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.22 
 
 
306 aa  467  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.16 
 
 
313 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  57.38 
 
 
320 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  55.22 
 
 
312 aa  337  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  53.47 
 
 
313 aa  333  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  55.56 
 
 
312 aa  331  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.44 
 
 
311 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.49 
 
 
312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53 
 
 
316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.69 
 
 
323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  52.7 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  54.05 
 
 
311 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.67 
 
 
313 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.08 
 
 
311 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.67 
 
 
313 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  53.2 
 
 
306 aa  323  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  51.53 
 
 
311 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.67 
 
 
313 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.4 
 
 
310 aa  322  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.4 
 
 
310 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
313 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  52.01 
 
 
314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  52.35 
 
 
302 aa  319  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.01 
 
 
309 aa  318  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  53.62 
 
 
313 aa  318  9e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  52.74 
 
 
310 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.35 
 
 
313 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  52.12 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.06 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.35 
 
 
318 aa  311  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  48.85 
 
 
309 aa  311  7.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.82 
 
 
308 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
308 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  50.33 
 
 
316 aa  310  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51 
 
 
307 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  51.5 
 
 
309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
318 aa  309  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
315 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  50.5 
 
 
312 aa  308  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.36 
 
 
310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 
315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.36 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  51.33 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  48.68 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.36 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  49.17 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
328 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
319 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.36 
 
 
319 aa  299  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
315 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  299  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  50.67 
 
 
305 aa  299  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
327 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
327 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
317 aa  297  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  51.45 
 
 
329 aa  297  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
315 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
315 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.84 
 
 
316 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
316 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
323 aa  295  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
312 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.63 
 
 
342 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
317 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
317 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3698  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
319 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.35 
 
 
318 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  47.57 
 
 
332 aa  293  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.86 
 
 
319 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  49.83 
 
 
333 aa  293  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
320 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1334  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
311 aa  292  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
341 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
320 aa  292  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  47.12 
 
 
318 aa  291  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4614  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
320 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.63 
 
 
337 aa  291  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.35 
 
 
318 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
341 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
320 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.36 
 
 
318 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49 
 
 
316 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2481  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.49 
 
 
316 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  47.04 
 
 
313 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.17 
 
 
346 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  47.48 
 
 
327 aa  289  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0719  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.54 
 
 
308 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.778436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.52 
 
 
308 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.67 
 
 
336 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>