More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0335 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  59.79 
 
 		 587 aa  722    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  55.61 
 
 		 584 aa  671    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 		 588 aa  1200    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  47.82 
 
 		 586 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  47.2 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  47.28 
 
 		 588 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  46.57 
 
 		 589 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  46.41 
 
 		 590 aa  540  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 600 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  42.38 
 
 		 586 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 594 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  40.92 
 
 		 611 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  40.75 
 
 		 614 aa  472  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  39.9 
 
 		 611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  41.75 
 
 		 619 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  39.79 
 
 		 603 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  40.34 
 
 		 608 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  40.21 
 
 		 613 aa  452  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  40.45 
 
 		 592 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  39.09 
 
 		 611 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  41.2 
 
 		 600 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  39.86 
 
 		 597 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  37.77 
 
 		 622 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  39.26 
 
 		 610 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  40.03 
 
 		 602 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  38.45 
 
 		 607 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  37.67 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  38.06 
 
 		 616 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  36.24 
 
 		 602 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  36.35 
 
 		 603 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  44.64 
 
 		 650 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  35.66 
 
 		 635 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.73 
 
 		 592 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  37.37 
 
 		 597 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  37.37 
 
 		 597 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  37.27 
 
 		 625 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  37.09 
 
 		 625 aa  399  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.66 
 
 		 608 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  36.93 
 
 		 594 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.68 
 
 		 598 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.97 
 
 		 589 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  37.05 
 
 		 607 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.47 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  35.99 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.19 
 
 		 617 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  36.16 
 
 		 587 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.92 
 
 		 617 aa  392  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  36.63 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.61 
 
 		 614 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  35.86 
 
 		 587 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 587 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.92 
 
 		 598 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 587 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.41 
 
 		 602 aa  387  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.86 
 
 		 587 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  35.01 
 
 		 588 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.14 
 
 		 610 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.86 
 
 		 587 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.79 
 
 		 587 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  35.41 
 
 		 598 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.58 
 
 		 598 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.6 
 
 		 598 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.79 
 
 		 587 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.41 
 
 		 598 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.6 
 
 		 598 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.41 
 
 		 598 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  35.26 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  35.84 
 
 		 602 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.6 
 
 		 598 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  37 
 
 		 615 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.92 
 
 		 593 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.19 
 
 		 597 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  36.52 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  36.77 
 
 		 620 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.31 
 
 		 598 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  36.19 
 
 		 608 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  35.98 
 
 		 602 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  34.93 
 
 		 585 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  35.27 
 
 		 621 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.15 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 576 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  34.95 
 
 		 598 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  40.28 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.41 
 
 		 620 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.17 
 
 		 581 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  35.12 
 
 		 605 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  34.62 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.11 
 
 		 636 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  40.28 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  36.92 
 
 		 588 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.83 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.06 
 
 		 571 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  35.73 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.78 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.78 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.43 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  35.54 
 
 		 571 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.54 
 
 		 571 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.26 
 
 		 586 aa  364  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>