More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0316 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 92 aa  179  9.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  82.02 
 
 		 91 aa  150  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  76.4 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  74.16 
 
 		 93 aa  140  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  70.65 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  71.11 
 
 		 98 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  72.22 
 
 		 98 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  68.48 
 
 		 92 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  71.91 
 
 		 89 aa  134  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 100 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  56.7 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 		 98 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  58.16 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  59.79 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  54.64 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  56.12 
 
 		 127 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  56.12 
 
 		 127 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  56.12 
 
 		 127 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0244  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  56.12 
 
 		 100 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 96 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  56.12 
 
 		 100 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  57.14 
 
 		 100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 97 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  56.38 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 94 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  55.21 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 95 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  52.58 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 		 98 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  55.67 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  54.64 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  53.19 
 
 		 97 aa  104  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>