116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0298 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  54.9 
 
 
781 aa  799    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  63.6 
 
 
772 aa  1041    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  62.65 
 
 
782 aa  1028    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  58.94 
 
 
759 aa  889    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  68.02 
 
 
758 aa  1027    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  63.11 
 
 
774 aa  963    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  65.3 
 
 
780 aa  986    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  47.25 
 
 
755 aa  646    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
760 aa  1589    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  35.09 
 
 
778 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  34.94 
 
 
1426 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  34.86 
 
 
1124 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.77 
 
 
1322 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  34.58 
 
 
759 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  33.46 
 
 
1427 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  34.79 
 
 
769 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.42 
 
 
807 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  33.6 
 
 
1422 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  32.5 
 
 
1114 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  34.43 
 
 
762 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  32.89 
 
 
976 aa  389  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  31.85 
 
 
747 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  33.42 
 
 
785 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  32.87 
 
 
761 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  32.22 
 
 
742 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 
753 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  33.17 
 
 
754 aa  379  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  32.74 
 
 
771 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  32.47 
 
 
751 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  34.37 
 
 
784 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  33.07 
 
 
775 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  32.22 
 
 
747 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.38 
 
 
784 aa  365  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  32.81 
 
 
706 aa  364  3e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  32 
 
 
773 aa  364  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.54 
 
 
771 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  33.25 
 
 
777 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  31.8 
 
 
1073 aa  352  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  31.57 
 
 
1053 aa  351  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.13 
 
 
827 aa  346  8e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1609  alpha-1,2-mannosidase  30.21 
 
 
701 aa  342  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.48 
 
 
741 aa  326  1e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  31.08 
 
 
790 aa  312  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  31.58 
 
 
797 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  30.07 
 
 
1089 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  30.95 
 
 
790 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  30.56 
 
 
1075 aa  303  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  29.28 
 
 
795 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  28.87 
 
 
771 aa  298  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  31.73 
 
 
728 aa  296  9e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.08 
 
 
769 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  27.53 
 
 
1084 aa  286  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  28.76 
 
 
757 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  28.48 
 
 
740 aa  282  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  29.16 
 
 
745 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  28.42 
 
 
760 aa  280  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  29.47 
 
 
716 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  28.61 
 
 
749 aa  278  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  31.32 
 
 
751 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14540  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.85 
 
 
1034 aa  273  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.254996  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.92 
 
 
912 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  27.67 
 
 
1189 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.31 
 
 
764 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  28.71 
 
 
899 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  28.45 
 
 
826 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.66 
 
 
771 aa  264  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  28.51 
 
 
877 aa  264  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  28.32 
 
 
826 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  28.52 
 
 
943 aa  259  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.32 
 
 
888 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  27.1 
 
 
818 aa  253  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  26.91 
 
 
818 aa  252  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.71 
 
 
964 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.64 
 
 
955 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.64 
 
 
955 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.64 
 
 
986 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.64 
 
 
986 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.64 
 
 
986 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  27.51 
 
 
986 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.2 
 
 
886 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  28.2 
 
 
886 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  27.51 
 
 
986 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  28.2 
 
 
886 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  27.09 
 
 
757 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  27.12 
 
 
768 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  27.39 
 
 
961 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  27.18 
 
 
821 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  28.13 
 
 
811 aa  238  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.33 
 
 
753 aa  231  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  27.19 
 
 
806 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  26.81 
 
 
808 aa  230  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  27.42 
 
 
901 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  25.49 
 
 
890 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.28 
 
 
846 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  25.52 
 
 
849 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  24.15 
 
 
802 aa  207  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  25.06 
 
 
839 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.55 
 
 
819 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  26.55 
 
 
819 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  26.55 
 
 
819 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>