116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0150 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  100 
 
 
443 aa  893    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  60.41 
 
 
439 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  55.56 
 
 
441 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 
439 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  47.61 
 
 
437 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 
430 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  43.84 
 
 
431 aa  342  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  43.65 
 
 
435 aa  339  5e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
421 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  34.95 
 
 
453 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  34.49 
 
 
453 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  31.76 
 
 
446 aa  190  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
442 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  31.8 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  28.41 
 
 
451 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.9 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  28.09 
 
 
448 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
450 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  28.87 
 
 
440 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  28.09 
 
 
464 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  28.31 
 
 
464 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  30.07 
 
 
427 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  29.62 
 
 
427 aa  156  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
458 aa  156  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  29.84 
 
 
427 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  29.89 
 
 
427 aa  154  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  26.55 
 
 
462 aa  153  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  30.29 
 
 
427 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
469 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
572 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  30.07 
 
 
427 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  30.07 
 
 
427 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  30.07 
 
 
427 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  30.07 
 
 
427 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  30.07 
 
 
427 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  30.07 
 
 
427 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
404 aa  150  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  28.8 
 
 
465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
426 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  31.58 
 
 
454 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
419 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
439 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  26.87 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  26.16 
 
 
416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
421 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  27.51 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  28.54 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 
428 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  26.98 
 
 
436 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  25.05 
 
 
458 aa  123  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  28.12 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  23.2 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  28.15 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  28.21 
 
 
435 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  28.21 
 
 
460 aa  103  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  22.7 
 
 
435 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  22.17 
 
 
426 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  23.52 
 
 
465 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  24.21 
 
 
430 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  23 
 
 
462 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  22.88 
 
 
463 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  22.22 
 
 
465 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  24.58 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  22.91 
 
 
455 aa  90.5  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  21.66 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  21.4 
 
 
462 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  23.04 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  21.75 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  22.36 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  22.78 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  22.25 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  22.47 
 
 
493 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  23.25 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  24.52 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  20.39 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  21.17 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  24.26 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  22.13 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  20.95 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  21.19 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  22.53 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  20.26 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  20.98 
 
 
449 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  22.42 
 
 
463 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 
467 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  19.91 
 
 
444 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  21.67 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  21.37 
 
 
456 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07591  Autophagy-related protein 22-2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVT9]  23.69 
 
 
593 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  23.61 
 
 
492 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  22.2 
 
 
472 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>