60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0139 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  100 
 
 		 80 aa  161  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  62.67 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  62.67 
 
 		 96 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  60 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  55.84 
 
 		 99 aa  98.6  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  61.33 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  56 
 
 		 99 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  41.33 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  35.53 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  35.06 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  39.47 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  40 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  38.24 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  34.67 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  32.89 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  43.64 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  34.38 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 		 327 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  33.78 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  36.76 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  30.67 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  35.38 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  34.38 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  32.81 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  32.81 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  35.9 
 
 		 326 aa  50.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  37.88 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  32.81 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  29.73 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 		 330 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  35.38 
 
 		 114 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  30.67 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  33.85 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  32.88 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  31.34 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 		 332 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  27.63 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.399116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>