More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0130 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  52.34 
 
 
603 aa  647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  53.96 
 
 
598 aa  658    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  70.85 
 
 
599 aa  876    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 
616 aa  644    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 
595 aa  636    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  68.52 
 
 
599 aa  863    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.85 
 
 
599 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  71.05 
 
 
604 aa  886    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  55.83 
 
 
611 aa  683    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  81.48 
 
 
598 aa  1008    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 
606 aa  666    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 
601 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 
600 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  52.68 
 
 
603 aa  659    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  53.24 
 
 
600 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 
598 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 
632 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  52.65 
 
 
596 aa  638    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.99 
 
 
596 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 
596 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.71 
 
 
614 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.36 
 
 
602 aa  669    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 
610 aa  675    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  53.58 
 
 
600 aa  658    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  54.78 
 
 
602 aa  665    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.81 
 
 
598 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  69.44 
 
 
604 aa  869    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.7 
 
 
599 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  52.44 
 
 
598 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  52.82 
 
 
597 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
603 aa  638    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  53.6 
 
 
604 aa  649    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  53.16 
 
 
597 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  52.78 
 
 
598 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  53.34 
 
 
605 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  52.02 
 
 
604 aa  641    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 
603 aa  655    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  66.39 
 
 
604 aa  837    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 
597 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
595 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.67 
 
 
593 aa  678    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  52.94 
 
 
598 aa  643    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  80.9 
 
 
598 aa  1011    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  53.37 
 
 
605 aa  658    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 
627 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  69.28 
 
 
602 aa  859    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 
596 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
601 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  53.18 
 
 
602 aa  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 
608 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  53.51 
 
 
605 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 
605 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  52.61 
 
 
598 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
613 aa  641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  53.17 
 
 
600 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 
608 aa  640    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 
597 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
601 aa  1223    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 
601 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 
606 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  53.42 
 
 
603 aa  631  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 
610 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 
610 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
606 aa  628  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  51.03 
 
 
592 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
606 aa  631  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  53.12 
 
 
608 aa  631  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 
606 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 
606 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 
613 aa  628  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
610 aa  627  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 
608 aa  626  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  52.25 
 
 
608 aa  625  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  51.5 
 
 
600 aa  625  1e-178  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 
606 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  51.17 
 
 
600 aa  625  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
608 aa  625  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
607 aa  626  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 
606 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  52.11 
 
 
608 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 
615 aa  624  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 
602 aa  625  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3029  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 
605 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 
608 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
608 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  49.42 
 
 
614 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 
614 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  51.91 
 
 
607 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52 
 
 
602 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  52.34 
 
 
603 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 
615 aa  624  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  49.25 
 
 
614 aa  621  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  50.25 
 
 
613 aa  620  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  49.25 
 
 
614 aa  621  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  49.25 
 
 
614 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 
609 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  52.09 
 
 
604 aa  621  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
602 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 
607 aa  618  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
603 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>