More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0127 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 931 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 876 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 876 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 875 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 874 aa  684    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 875 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 874 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 876 aa  1007    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 874 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 867 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 874 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 884 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 876 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 876 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 874 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 892 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 874 aa  686    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 874 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 874 aa  680    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 860 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  68.94 
 
 		 879 aa  1239    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 874 aa  687    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 860 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 860 aa  651    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 874 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 899 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 897 aa  673    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 871 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 874 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 886 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 865 aa  653    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 879 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 874 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  43.48 
 
 		 873 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 874 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 874 aa  704    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 882 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 897 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 887 aa  702    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 886 aa  744    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 876 aa  702    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 880 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 864 aa  682    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 897 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 874 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 872 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 872 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 862 aa  656    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 874 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 881 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 874 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 905 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 874 aa  684    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 875 aa  709    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 892 aa  689    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 876 aa  661    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 876 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 903 aa  646    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 874 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 878 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 874 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 874 aa  696    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 905 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 868 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 904 aa  676    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 890 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 884 aa  693    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 874 aa  686    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 865 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 874 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 897 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 892 aa  663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 865 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 875 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 877 aa  1063    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 863 aa  691    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 875 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 874 aa  691    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 874 aa  661    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 874 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 874 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 869 aa  705    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 874 aa  702    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 875 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 875 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 874 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 874 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 874 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 865 aa  652    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 874 aa  698    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 876 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 897 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 878 aa  672    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 874 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 874 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 878 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 888 aa  751    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 876 aa  711    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 900 aa  685    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 867 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>