More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0100 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 249 aa  510  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  63.6 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  62 
 
 		 250 aa  324  8.000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  52.19 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.16 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  50.6 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  47.98 
 
 		 256 aa  245  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48.22 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 646 aa  232  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 249 aa  231  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  43.8 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  44.35 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 655 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  44.98 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  45.93 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 654 aa  222  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  44.18 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6209  triosephosphate isomerase  48.13 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.74008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  44.35 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  42.51 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  42.23 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 257 aa  218  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  41.94 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  46.8 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 246 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  42.28 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  42.23 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>