More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0098 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
313 aa  633    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  66.13 
 
 
314 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.75 
 
 
311 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  62.38 
 
 
311 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  58.01 
 
 
313 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.02 
 
 
314 aa  362  6e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.95 
 
 
315 aa  333  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.62 
 
 
323 aa  255  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.81 
 
 
323 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.87 
 
 
314 aa  249  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  44.87 
 
 
314 aa  249  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.93 
 
 
325 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.38 
 
 
317 aa  245  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.45 
 
 
309 aa  245  9e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.77 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  42.43 
 
 
316 aa  242  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  43.45 
 
 
326 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.45 
 
 
325 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  41.35 
 
 
316 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.51 
 
 
313 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.05 
 
 
315 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.59 
 
 
325 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  41.45 
 
 
317 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.08 
 
 
329 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.85 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.32 
 
 
328 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.96 
 
 
324 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.16 
 
 
335 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.43 
 
 
328 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.39 
 
 
324 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.78 
 
 
342 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.74 
 
 
331 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  39.61 
 
 
324 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.07 
 
 
324 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.76 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.49 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.49 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.49 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.62 
 
 
324 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  40 
 
 
332 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.74 
 
 
331 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.37 
 
 
325 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  41.4 
 
 
321 aa  223  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.59 
 
 
323 aa  222  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  42.86 
 
 
323 aa  222  8e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  41.35 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.63 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.85 
 
 
330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.41 
 
 
328 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.25 
 
 
327 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.05 
 
 
332 aa  218  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.67 
 
 
319 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.13 
 
 
319 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.14 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.45 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.74 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.9 
 
 
319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  41.97 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  40.06 
 
 
315 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.84 
 
 
312 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.24 
 
 
323 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  41.25 
 
 
334 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  36.68 
 
 
328 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.46 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.86 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  42.77 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.09 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.05 
 
 
328 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.3 
 
 
313 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.98 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.98 
 
 
326 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.59 
 
 
327 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  40.13 
 
 
318 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.13 
 
 
339 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.59 
 
 
305 aa  188  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.94 
 
 
305 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  38.89 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.68 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.12 
 
 
338 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.83 
 
 
355 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.69 
 
 
345 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.18 
 
 
326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.6 
 
 
352 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.13 
 
 
334 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.13 
 
 
342 aa  157  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.83 
 
 
345 aa  157  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  32.43 
 
 
348 aa  156  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.39 
 
 
356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.01 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.08 
 
 
338 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  30.7 
 
 
355 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.64 
 
 
356 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.39 
 
 
356 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.05 
 
 
360 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.64 
 
 
356 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.64 
 
 
356 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.56 
 
 
369 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.88 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.7 
 
 
354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.88 
 
 
386 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>