More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0094 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 170 aa  354  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.2 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  33.54 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  28.48 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  28.31 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  28.31 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.05 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.05 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.05 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  29.05 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.05 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  29.05 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  29.05 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  29.05 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 298 aa  60.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  25.29 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  23.81 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  24.71 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  27.16 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  25.33 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  28 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  26.32 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.52 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  32.99 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19860  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  26.67 
 
 		 279 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  26.54 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  33.61 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  28.77 
 
 		 257 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  29.73 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  28.08 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  30.41 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  29.73 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  25.34 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  27.4 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  25.75 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  25.93 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  24.24 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  25.98 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  27.4 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  27.4 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 525 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  27.4 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  27.4 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  27.4 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  27.4 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  25.15 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  33.07 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  26.72 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  29.05 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  24.16 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>