More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0093 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0093  dihydroorotase  100 
 
 		 418 aa  858    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08046  Dihydroorotase  54.44 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2449  amidohydrolase  53.35 
 
 		 416 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.23 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.7 
 
 		 434 aa  308  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  40.48 
 
 		 421 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.9 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 		 419 aa  283  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.02 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.83 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.26 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.59 
 
 		 425 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.89 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.46 
 
 		 425 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  36 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.53 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.02 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.59 
 
 		 425 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.45 
 
 		 425 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.04 
 
 		 424 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.01 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  34.79 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  35.53 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.91 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  34.15 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.2 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.59 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  34.95 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.77 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.49 
 
 		 430 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 		 433 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  35.45 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.66 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  33.8 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 		 435 aa  222  8e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  33.33 
 
 		 425 aa  222  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  33.41 
 
 		 427 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  34.7 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  33.33 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.72 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.79 
 
 		 433 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  32.94 
 
 		 433 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.49 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  33.65 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.49 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  31.74 
 
 		 433 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  32.45 
 
 		 430 aa  212  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.14 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.73 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  33.25 
 
 		 432 aa  210  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 		 448 aa  209  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.05 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  33.57 
 
 		 426 aa  208  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  34.77 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  34.09 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.09 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  31.5 
 
 		 433 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.13 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  30.95 
 
 		 433 aa  206  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.77 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  35.22 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  31.43 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  30.83 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.54 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  30.77 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  32.53 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  30 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  33.33 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  34.35 
 
 		 428 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  32.1 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  31.39 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  32.35 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  32.61 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.77 
 
 		 488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  31.9 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  30.34 
 
 		 425 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  30.58 
 
 		 425 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.01 
 
 		 433 aa  196  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.42 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.82 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  32.54 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  32.33 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.08 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  30.34 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.13 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.6 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  30.91 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  31.93 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  32.41 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3650  dihydroorotase  31.32 
 
 		 435 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0755  dihydroorotase multifunctional complex type  31.82 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.2 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  29.83 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  32.08 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  31.71 
 
 		 440 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  32.63 
 
 		 435 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  30.1 
 
 		 425 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  32.39 
 
 		 462 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  30.1 
 
 		 425 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>