More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0087 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 389 aa  813    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  51.68 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  44.27 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  42.19 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  44.67 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  44.67 
 
 		 393 aa  361  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  44.42 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  44.27 
 
 		 401 aa  352  8.999999999999999e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  41.69 
 
 		 390 aa  351  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 		 386 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  43.48 
 
 		 395 aa  339  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  41.69 
 
 		 393 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  39.74 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  39.58 
 
 		 383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  39.32 
 
 		 383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  40.51 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  39.32 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  39.32 
 
 		 383 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  39.32 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  39.06 
 
 		 383 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  38.14 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  39.06 
 
 		 383 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  39.06 
 
 		 383 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  38.54 
 
 		 383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  39.04 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  38.28 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  41.03 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  36.9 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 		 521 aa  300  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 		 391 aa  298  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  38.21 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  40.26 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  36.18 
 
 		 386 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  37.69 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  36.92 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  38.3 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  38.02 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  38.05 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  36.52 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  38.7 
 
 		 412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  36.72 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  38.4 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  36.72 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  35.05 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  35.53 
 
 		 399 aa  276  6e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  33.83 
 
 		 405 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  35.32 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  36.02 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  36.9 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  34.95 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  36.92 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  35.68 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  34.27 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  32.4 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  33.59 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  35.4 
 
 		 392 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  32.74 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  33.59 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  34.01 
 
 		 387 aa  249  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  34.03 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  34.02 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  34.64 
 
 		 392 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  34.01 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  33.07 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  35.78 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  33.08 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  34.53 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  33.07 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  31.71 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  31.71 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  31.46 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  31.46 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  31.46 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  31.46 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  31.46 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  31.46 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  31.46 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  33.61 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  32.82 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1952  bifunctional PLP-dependent enzyme  33.25 
 
 		 403 aa  239  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  32.32 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  33.74 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2960  aminotransferase, classes I and II  31.96 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  34.02 
 
 		 400 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 		 400 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 		 402 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  31.44 
 
 		 393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>